Licence d'Histoire à Paris Sorbonne, échange à American University à Washington en 2009, puis Master à la Columbia University Graduate School of Journalism à New York. À l'issue de ses études, elle reçoit la bourse Margaret Moth de CNN.
Premiers pas pour Voice of America, puis correspondante Canal+ à Washington. En parallèle, collaborations freelance avec BBC, ITN, NBC News et Al Jazeera English. En 2012, elle obtient également la bourse Inside Story d'Al Jazeera English, à Washington.
Sept ans à CNN International, entre Atlanta, Londres, Paris et l'Afrique de l'Ouest. Aux côtés de Clarissa Ward, Nima Elbagir et Christiane Amanpour, reportages au Moyen-Orient, en Afrique de l'Ouest, en Europe et Russie, dont plusieurs enquêtes sur les réseaux djihadistes. Récompensée par un Edward R. Murrow Award avec CNN.
Retour en France en 2020 avec BFM TV, puis Smart World with CNBC, format bilingue qu'elle produit et présente sur BSmart en partenariat avec CNBC. Productrice éditoriale du documentaire Netflix sur Dominique Strauss-Kahn. Depuis 2022, journaliste et éditorialiste à LCI. Depuis 2024, elle présente le rendez-vous de 20h du week-end, en remplacement de Darius Rochebin : d'abord « Face à Margot Haddad », puis « Un Œil sur le monde » à la rentrée 2025, et depuis la rentrée 2026 « 20H Haddad ». En octobre 2026, elle publie « Trump, une tentation française » aux Éditions du Cerf.
Également récompensée par le Robert Bosch Award, prix du journalisme européen.
En couple, engagée pour la cause animale.
En 2017, Margot Haddad enseignait à Sciences Po Paris, où elle dispensait des cours de reportage télévisé en anglais.